スタンダードプランとプレミアムプランでのパフォーマンスに差があるようです。

phpのアップローダーを作成していたところ
スタンダードプランでは、200MBを超えるファイルをアップロードすると蹴られてしまいます。

phpで利用するメモリ容量に上限があるようです。
php.ini の設定など色々と弄ってみましたが、
プレミアムプランの無料期間を利用してテストするとすんなり。。。
230MBのファイルアップロードができました。

ちなみにphp.iniがコントロールパネル上でできる「さくら」は使いかってに優れていますね。

設定はこんな感じ

upload_max_filesize = 1G
post_max_size = 1G
memory_limit = -1
max_input_time = 600
max_execution_time = 600

同じことで悩まれる方がいるかも知れないので公開しておきます。